工(gōng )藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后(hòu )喂了(le )神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他(tā )的(de )阿笠(lì )博士，博士为他(tā )度(dù )身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗(àn )中追查他们(men )，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰(lán )来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友(yǒu )的下落，被小兰撞(zhuàng )见的(de )新一情(qíng )急(jí )之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名(míng )私家侦探，新一(yī )可以(yǐ )籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在(zài )小学(xué )认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！