工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪(zuì )团(tuán )伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找(zhǎo )到了(le )经常(cháng )帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见(jiàn )的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛(máo )利(lì )小五郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出(chū )办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南在(zài )小学认识(shí )步(bù )美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪(zuì )犯宣战(zhàn )！