工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的(de )药水，工藤新一变(biàn )回了小孩(hái )！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对(duì )他进行报(bào )复(fù )，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找(zhǎo )男(nán )友的下落，被小兰(lán )撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户(hù )川柯南，随后柯南(nán )寄居在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是(shì )一名私家侦探(tàn )，新(xīn )一可以(yǐ )籍着和(hé )他一起(qǐ )四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了(le )一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！