工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造(zào )不少(shǎo )间谍(dié )武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进(jìn )行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们(men )，希望能(néng )得到(dào )解药。一日，新(xīn )一 的女友(yǒu )毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户(hù )川(chuān )柯(kē )南，随(suí )后柯(kē )南寄居在了小兰(lán )家。小兰的(de )父亲毛利小五郎(láng )是一(yī )名私家侦探(tàn )，新(xīn )一可(kě )以籍着和(hé )他一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小(xiǎo )学(xué )生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪(zuì )犯宣战！