工藤新一是全国著(zhe )名的(de )高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不(bú )幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新(xīn )一变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进(jìn )行报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被(bèi )小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小兰(lán )家(jiā )。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名(míng )私(sī )家侦(zhēn )探，新一可以籍(jí )着和他一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯(kē )南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪(zuì )犯宣战！