工藤新一是(shì )全(quán )国著名的(de )高中(zhōng )生侦探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣(yī )人犯罪团伙(huǒ )时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇(qí )的药水，工藤(téng )新一变(biàn )回了(le )小孩！新一找到了(le )经常(cháng )帮助他的(de )阿笠博士(shì )，博(bó )士为他度身(shēn )打造不(bú )少间谍武器。为了(le )防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中(zhōng )追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的(de )下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父(fù )亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出(chū )办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一(yī )起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！