工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人(rén )犯(fàn )罪团伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行(háng )报复(fù )，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名(míng )，暗(àn )中(zhōng )追查他(tā )们，希(xī )望能得到解药。一日(rì )，新一 的(de )女友毛利兰来到了(le )阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名(míng )叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认识(shí )步(bù )美(měi )等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！