工藤新一是全国(guó )著名的高中(zhōng )生侦探，在一(yī )次追查黑衣(yī )人(rén )犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了(le )神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回(huí )了小孩！新一(yī )找(zhǎo )到了经(jīng )常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能(néng )得(dé )到解药。一日(rì )，新一(yī ) 的(de )女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找(zhǎo )男友的下(xià )落，被小兰撞见的(de )新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯(kē )南(nán )寄居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了一(yī )个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！