工藤(téng )新一是全国(guó )著名的(de )高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕(yūn )后喂了(le )神奇的(de )药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造(zào )不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到(dào )了阿(ā )笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编(biān )造(zào )了自己名叫(jiào )江户川柯南，随(suí )后柯南寄(jì )居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南(nán )在小学认识步美等(děng )小学生，他(tā )们(men )一起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪(zuì )犯宣战！