工藤新一是全国(guó )著名的高中(zhōng )生侦探(tàn )，在(zài )一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮(bāng )助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身(shēn )打造不(bú )少间谍武器(qì )。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一(yī )决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿(ā )笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急之下(xià )编造(zào )了自(zì )己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰(lán )的父亲毛利(lì )小五郎是一(yī )名私(sī )家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步(bù )美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！