工藤(téng )新一(yī )是全国著名的(de )高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找(zhǎo )到了经常(cháng )帮助他(tā )的阿笠博士，博士为(wéi )他度(dù )身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们(men )，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的(de )新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯(kē )南在小学(xué )认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战！