工藤新一是全国(guó )著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不幸被团(tuán )伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠(lì )博(bó )士(shì )，博士为他度身打造不(bú )少间(jiān )谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛(máo )利(lì )兰(lán )来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查黑(hēi )夜(yè )人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！