工藤新(xīn )一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇(qí )的药水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮助他(tā )的(de )阿笠博士，博(bó )士为他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到(dào )了阿笠(lì )博士的家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下(xià )编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲(qīn )毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认(rèn )识(shí )步美(měi )等(děng )小学(xué )生(shēng )，他们(men )一起组织了(le )一个少(shǎo )年侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯(fàn )宣战！