工藤新一是(shì )全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇(qí )的药水(shuǐ )，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名(míng )，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的(de )新(xīn )一情急之下编造了自(zì )己名(míng )叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲(qīn )毛利小五郎是一名(míng )私家侦(zhēn )探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查(chá )黑夜(yè )人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一(yī )个少年侦(zhēn )探团，向罪犯(fàn )宣(xuān )战！