工藤新一是全国著名(míng )的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸(xìng )被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找(zhǎo )到了(le )经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进(jìn )行(háng )报复(fù )，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能(néng )得到解药。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛(máo )利兰来到(dào )了阿笠博士的家(jiā )寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父亲(qīn )毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一(yī )起追查(chá )黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了(le )一个(gè )少年侦探团，向罪(zuì )犯(fàn )宣战！