工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩(hái )！新一找到(dào )了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防(fáng )止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复(fù )，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一(yī ) 的女友(yǒu )毛利(lì )兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新(xīn )一情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南(nán )寄(jì )居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私(sī )家侦(zhēn )探，新一可(kě )以籍着和他(tā )一起(qǐ )四出(chū )办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识(shí )步(bù )美等(děng )小学(xué )生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣(xuān )战！