工(gōng )藤新一是全国著(zhe )名(míng )的高中(zhōng )生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸(xìng )被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了(le )经常帮助(zhù )他的(de )阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中(zhōng )追(zhuī )查他们(men )，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和(hé )他一起四(sì )出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个(gè )少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪(zuì )犯宣战！