工藤(téng )新(xīn )一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣(yī )人(rén )犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了(le )小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望(wàng )能(néng )得到解(jiě )药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来(lái )到了(le )阿(ā )笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎(láng )是一名私家侦探，新(xīn )一可以(yǐ )籍着和他一起(qǐ )四出办案一起(qǐ )追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小(xiǎo )学生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！