工藤新一是(shì )全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打(dǎ )造(zào )不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望能得到(dào )解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友(yǒu )毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一(yī )情急之下编造(zào )了(le )自己名叫(jiào )江户川柯南，随(suí )后柯(kē )南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小(xiǎo )学生，他们一(yī )起组(zǔ )织了一个少年(nián )侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯宣战！