工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣(yī )人(rén )犯(fàn )罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了(le )神(shén )奇的药(yào )水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间(jiān )谍武器。为(wéi )了(le )防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一情急(jí )之下编造了自己名叫江户(hù )川柯南，随后(hòu )柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一(yī )名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他(tā )一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识(shí )步美(měi )等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！