工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一(yī )找(zhǎo )到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙对(duì )他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋(mái )名(míng )，暗中追查他(tā )们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的(de )新(xīn )一情急之下编造了自己名叫江户(hù )川柯(kē )南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新(xīn )一可以(yǐ )籍着和(hé )他(tā )一起(qǐ )四出办案(àn )一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少(shǎo )年侦(zhēn )探团，向罪犯(fàn )宣战！