工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探(tàn )，在一次(cì )追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报复，新(xīn )一(yī )决定隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的(de )女(nǚ )友(yǒu )毛利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利(lì )小五郎(láng )是一名私家侦(zhēn )探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在小学认(rèn )识(shí )步美(měi )等(děng )小(xiǎo )学生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！