工藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次(cì )追(zhuī )查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药(yào )水，工藤新一变回(huí )了小孩！新(xīn )一找到了(le )经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为(wéi )了防(fáng )止犯(fàn )罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的(de )女友(yǒu )毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找(zhǎo )男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下(xià )编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可(kě )以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查(chá )黑夜人的(de )下落。柯南在小学认(rèn )识步美等(děng )小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪(zuì )犯宣战！