工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一(yī )找到(dào )了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不(bú )少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团(tuán )伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗(àn )中追(zhuī )查他们，希(xī )望(wàng )能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻找男友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯(kē )南(nán )，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追查(chá )黑夜人(rén )的下落。柯南在(zài )小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦(zhēn )探(tàn )团，向(xiàng )罪(zuì )犯(fàn )宣战(zhàn )！