工藤新一是全国著(zhe )名的高中生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神(shén )奇(qí )的(de )药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠(lì )博士，博士为他度(dù )身打造不少间谍(dié )武器(qì )。为了(le )防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新(xīn )一决定(dìng )隐姓(xìng )埋(mái )名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之(zhī )下(xià )编造了自己名叫江户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的(de )父亲(qīn )毛利小(xiǎo )五郎(láng )是(shì )一名私家侦探(tàn )，新一可以(yǐ )籍着和他(tā )一起四出办案一(yī )起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣战！