工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击(jī )晕后喂了(le )神奇的(de )药(yào )水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博(bó )士(shì )，博士为他度身(shēn )打造不少间(jiān )谍武器(qì )。为了防(fáng )止(zhǐ )犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们(men )，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻(xún )找男友的下(xià )落(luò )，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰(lán )家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落(luò )。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！