工(gōng )藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了(le )经常帮(bāng )助(zhù )他的(de )阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍(dié )武器。为了防止犯罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行报(bào )复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药(yào )。一日，新一 的女友(yǒu )毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰(lán )家(jiā )。小兰(lán )的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落(luò )。柯南在小学认(rèn )识步美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪(zuì )犯宣战！