工藤新一是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士(shì )为(wéi )他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进(jìn )行报复，新(xīn )一决(jué )定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗(àn )中追(zhuī )查他们，希望(wàng )能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被(bèi )小兰撞见的(de )新一情(qíng )急之下(xià )编造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南(nán )寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛利小五郎(láng )是一(yī )名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在(zài )小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦(zhēn )探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战(zhàn )！