工藤新一是全国著名的高(gāo )中(zhōng )生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间(jiān )谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一(yī )日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰来到了(le )阿笠博士(shì )的家寻找男友的下(xià )落，被小兰(lán )撞见的新一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名(míng )叫(jiào )江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄居在(zài )了(le )小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四(sì )出(chū )办案一起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学(xué )生，他们一(yī )起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！