工藤新一是(shì )全国著名的(de )高中生侦探(tàn )，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人(rén )犯(fàn )罪(zuì )团伙(huǒ )时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常(cháng )帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙(huǒ )对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见(jiàn )的新一情急(jí )之下编(biān )造了自(zì )己(jǐ )名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居在了(le )小兰家(jiā )。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办(bàn )案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小(xiǎo )学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！