工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他(tā )度(dù )身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋(mái )名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找(zhǎo )男友的下(xià )落，被小兰撞见的新(xīn )一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家(jiā )侦(zhēn )探，新一可以籍着(zhe )和他(tā )一起四出办(bàn )案一(yī )起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识(shí )步美等小学生，他(tā )们一(yī )起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯(fàn )宣战！