工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时(shí )不(bú )幸(xìng )被团(tuán )伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了(le )经常(cháng )帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器(qì )。为了(le )防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药(yào )。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小兰的(de )父(fù )亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出(chū )办案一(yī )起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在(zài )小(xiǎo )学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！