工藤新一(yī )是全国(guó )著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成(chéng )员发(fā )现，击晕(yūn )后喂了神(shén )奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新(xīn )一找到了经(jīng )常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一(yī )情急之下(xià )编造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可(kě )以籍着和他一起四出(chū )办(bàn )案(àn )一起追查(chá )黑夜人(rén )的(de )下落(luò )。柯南在小学(xué )认识步美等(děng )小学生(shēng )，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！