工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一(yī )变(biàn )回了(le )小孩！新一找(zhǎo )到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决定(dìng )隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下(xià )落，被小兰(lán )撞见的新(xīn )一情急之下(xià )编造了自己名叫江户(hù )川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰(lán )的(de )父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战(zhàn )！