工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发现，击晕后(hòu )喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一(yī )变(biàn )回了(le )小孩！新一找到(dào )了(le )经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造(zào )不(bú )少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之下(xià )编造了自(zì )己名叫江(jiāng )户(hù )川柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起(qǐ )追(zhuī )查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！