工藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查(chá )他(tā )们，希望能得到解药。一日(rì )，新一(yī ) 的女友毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父(fù )亲(qīn )毛(máo )利小五(wǔ )郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探(tàn )，新一可以籍(jí )着(zhe )和(hé )他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜(yè )人的(de )下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等(děng )小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！