工(gōng )藤新一是全国著(zhe )名(míng )的高中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击(jī )晕(yūn )后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博(bó )士(shì )为他度(dù )身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对(duì )他进行报(bào )复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠(lì )博(bó )士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎(láng )是一名私(sī )家侦探，新(xīn )一可以籍(jí )着和他一起四出(chū )办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生(shēng )，他(tā )们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！