工藤新一是全国(guó )著(zhe )名的高中生(shēng )侦探，在一(yī )次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士(shì )，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希(xī )望能(néng )得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被小兰撞见(jiàn )的(de )新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一(yī )名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着(zhe )和他(tā )一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落(luò )。柯(kē )南在小学认识(shí )步美等小学生(shēng )，他们一起(qǐ )组织了一个(gè )少年(nián )侦探(tàn )团，向罪犯宣战！