工藤新一是全国(guó )著名的高中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人(rén )犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药(yào )水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博(bó )士，博(bó )士为(wéi )他(tā )度身打(dǎ )造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙(huǒ )对他进(jìn )行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们(men )，希望能得到解药(yào )。一(yī )日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小学生，他们一(yī )起组(zǔ )织了一个少(shǎo )年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！