工(gōng )藤新一(yī )是(shì )全(quán )国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的(de )阿笠(lì )博(bó )士，博士为他(tā )度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复(fù )，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰(lán )家。小兰(lán )的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案(àn )一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯(fàn )宣战(zhàn )！