工藤新一是全国著(zhe )名的高中生(shēng )侦探，在一(yī )次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发(fā )现(xiàn )，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决定隐姓埋(mái )名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和(hé )他一(yī )起四出办案(àn )一起(qǐ )追查黑(hēi )夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！