工藤新一是(shì )全国著名的高(gāo )中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮(bāng )助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打造不少间谍(dié )武(wǔ )器。为了(le )防(fáng )止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一(yī )决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他们，希(xī )望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之(zhī )下(xià )编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小(xiǎo )五(wǔ )郎(láng )是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一(yī )起四出(chū )办案一起追查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯(kē )南在小学认(rèn )识步美等小学生，他(tā )们一(yī )起组织了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！