工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查(chá )他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下(xià )落，被小兰(lán )撞见的新一情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江(jiāng )户川(chuān )柯(kē )南，随(suí )后柯南寄居(jū )在了小(xiǎo )兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以(yǐ )籍着和他一(yī )起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的(de )下落(luò )。柯南在(zài )小学认识步美(měi )等小学生，他们(men )一(yī )起组织了(le )一个少年侦(zhēn )探团，向罪(zuì )犯宣战！