工藤新一是全国著名的(de )高中生(shēng )侦(zhēn )探，在(zài )一次(cì )追查黑衣(yī )人犯罪团伙(huǒ )时不(bú )幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇的(de )药水，工藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮(bāng )助他的(de )阿笠博(bó )士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居(jū )在(zài )了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探(tàn )，新一可(kě )以籍着和(hé )他(tā )一(yī )起四出办案(àn )一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南在(zài )小学认识步美(měi )等小学(xué )生，他们一起组织(zhī )了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！