工藤新一是全国著(zhe )名的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑(hēi )衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不幸被(bèi )团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的(de )药水(shuǐ )，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他(tā )进行(háng )报复，新一决定隐(yǐn )姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的(de )新一(yī )情(qíng )急(jí )之下编造了自己名叫(jiào )江户(hù )川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父亲(qīn )毛利(lì )小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团(tuán )，向罪犯宣战(zhàn )！