工藤新一是全国著(zhe )名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女(nǚ )友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找(zhǎo )男友的下落(luò )，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛(máo )利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一(yī )起追查黑(hēi )夜人的(de )下落。柯南在(zài )小(xiǎo )学(xué )认(rèn )识步美等小学(xué )生(shēng )，他们一起(qǐ )组织(zhī )了一个(gè )少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！