工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新(xīn )一变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对(duì )他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰(lán )家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利(lì )小五郎是一名(míng )私家侦(zhēn )探，新一可(kě )以籍着(zhe )和他一(yī )起(qǐ )四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落(luò )。柯南在小(xiǎo )学认识(shí )步美等小学生，他们(men )一起组(zǔ )织了(le )一(yī )个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！