工藤新一是(shì )全国著(zhe )名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一变回(huí )了(le )小孩(hái )！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的(de )下落，被(bèi )小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造(zào )了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居在了(le )小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍(jí )着和他一起四(sì )出办案一起(qǐ )追(zhuī )查黑夜人(rén )的(de )下落。柯(kē )南在小(xiǎo )学认识(shí )步美(měi )等小学生(shēng )，他们(men )一(yī )起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！