工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了(le )小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武器。为(wéi )了防止犯(fàn )罪(zuì )团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追(zhuī )查他(tā )们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的(de )女友(yǒu )毛利兰来到了(le )阿笠博(bó )士的家寻找男友的下(xià )落，被小(xiǎo )兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私(sī )家侦探(tàn )，新一可以籍着和他(tā )一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认识步美等小学生，他们一(yī )起组(zǔ )织了一个少年(nián )侦探团(tuán )，向罪犯宣战！