工(gōng )藤新一(yī )是全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯(fàn )罪(zuì )团伙(huǒ )时不幸被(bèi )团伙成(chéng )员发现(xiàn )，击晕后喂了神(shén )奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新(xīn )一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠(lì )博士，博士为(wéi )他度(dù )身打造不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行(háng )报复(fù )，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一(yī ) 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自(zì )己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出(chū )办案一(yī )起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战(zhàn )！